Utbildningsminister Jan Björklund, beklagar i ett pressmeddelande att regeringen mister en av sina "mest erfarna ledamöter".
Lars Leijonborg berättade under torsdagens presskonferens att han redan i maj informerat Jan Björklund om att han bestämt sig för att lämna regeringen.
Björklund skriver i ett pressmeddelande att han har förståelse för Leijonborgs beslut.
– Han har slitit hårt i den svenska toppolitikens centrum sedan 1970-talet. Vi är skyldiga honom ett stort tack.
Utbildningsministern beskriver Lars Leijonborg som "den mest framgångsrike forskningsminister Sverige har haft i modern tid" och som "en av Sveriges mest rutinerade politiker".
I pressmeddelandet bekräftar Björklund att Leijonborgs efterträdare på posten som högskole- och forskningsminister kommer att utses runt midsommar. Enligt uppgifter till TT är det i skrivande stund dock inte klart vem efterträdaren blir, trots att besked väntas inom knappt två veckor.
Statsminister Fredrik Reinfeldt lägger sig inte i vem som blir efterträdare trots att det är han själv och ingen annan som enligt grundlagen utser sina ministrar.
Reinfeldt säger att han ännu inte vet vem efterträdaren blir.
– I en koalitionsregering fungerar det så att det är ingående partiledare som ansvarar för utnämningen även om det sker i samråd med mig. Jag överlåter åt Jan Björklund att bedöma vem som är lämplig, säger han till TT.
Socialminister Göran Hägglund skriver i ett uttalande till DN.se:
"Lars Leijonborg har en unikt lång erfarenhet av modern svensk politik. Hans främsta tillgångar är en bred och djup kunskap, en förmåga till ständigt nytänkande och en rik erfarenhet."
"Jag har haft förmånen att få samarbeta med Lars Leijonborg under nästan två decennier - som gruppledare, partiledare och som regeringskollega. Lars är lätt att samarbeta med. Han är principfast med en resonerande attityd. Ständigt med nya uppslag. Lars betydelse för tillkomsten av Allians för Sverige och därmed regeringsskiftet kan inte överskattas. Jag kommer att sakna Lars."