Det är den första omfattande studie som har gjorts på området.
Enligt uppdraget, som presenteras på torsdag i nästa vecka, ska Försäkringskassan borra i ett stort antal områden. Bland annat ska föräldrarnas yrken kartläggas, om de är ensamboende eller sammanboende, hur stora förvärvsinkomster de har och vilken deras socioekonomiska tillhörighet är.
Det ska även göras en analys av hur jämställt deras uttag av föräldrapenning har varit. I uppdraget ingår även att se hur ofta det är mammor eller pappor som är mottagare av vårdbidrag, eller som är personlig assistent åt sitt barn.
– Skillnaden mellan mäns och kvinnors sjukskrivningar är en av de stora frågorna inom sjukförsäkringen nu. Den här studien är oerhört viktig och jag är glad att den nu blir av, säger socialförsäkringsminister Ulf Kristersson (M), som tidigare har uppmärksammat kvinnors högre uttag av sjukpenning.
Bakgrunden är att svenska kvinnor i gruppen 30 till 39 år är mer än dubbelt så mycket sjukskrivna som männen i samma åldrar. Det är i den åldern som många lever familjeliv med små barn.
En rapport från IFAU, ett forskningsinstitut kopplat till arbetsmarknadsdepartementet, visar att kvinnors och mäns genomsnittliga uttag av sjukpenning är likvärdigt fram till att första barnet är ett år.
När det börjar bli dags för förskola drar mammornas sjukfrånvaro i väg. Och den stannar på en nivå klart över pappornas i många år.
– Det är en dramatisk utveckling, säger Ulf Kristersson.
Utredarna ska titta på vilka sjukdomsdiagnoser som kvinnorna har, hur länge de är sjukskrivna och hur ofta.
Även barnens sjukdomar ska studeras för att se om det finns kopplingar mellan att den som vabbar oftare blir smittad än den andra föräldern. I två fall av tre är det kvinnan som stannar hemma från jobbet och tar hand om det sjuka barnet. Det ska också utredas om det förekommer sjukdomar som kan kopplas till graviditeten och förlossningen.
Att kvinnor ofta är barnfamiljernas projektledare och logistiker är ett ämne som dyker upp i debatter, samt att dessa självpåtagna eller påtvingade arbetsuppgifter sliter på mammorna.
– Vi har varit duktiga på att öka kvinnornas deltagande i arbetslivet, men vi har inte ökat männens ansvar att delta i familjen i samma omfattning. Det verkar främst vara kvinnor som drabbas när jobbet och familjelivet krockar. Det som kvinnorna då kan sjukskriva sig från är jobbet.
Kvinnornas sjukfrånvaro har allvarliga konsekvenser, enligt Ulf Kristersson. De får lägre inkomster, vilket även påverkar deras pension och de kan hamna i en sämre sits på sitt arbete.
Förutom att deras möjlighet att göra karriär kan försämras finns också risken att kvinnor som ett kollektiv blir mindre attraktivt bland arbetsgivare.
– Sådana argument har vi ju hört när det gäller föräldraledighet och vabbande, säger Ulf Kristersson.