Bistrons meny ropades ut i högtalarna på tåget med slutklämmen ”...och så har vi negerbollar också”.
Många resenärer reagerade och SJ beklagar nu ordvalet.
– Inte särskilt smart eller korrekt, säger biträdande presschef Ulf Wallin till Sveriges Radio Väst.
Händelsen inträffade på X 2000 mellan Göteborg och Stockholm på torsdagen.
Diskrimineringsombudsmannen har tidigare klassat ordet som olämpligt eftersom det kan förknippas med slaveri och rasism. Den gången gällde det ett konditori i Sjöbo.