Prabhakaran är mytomspunnen. Han har alltid varit den självklare ledaren för LTTE, som han själv grundade på 1970-talet.
Han krävde obrottsligt lojalitet och kadaverdisciplin från sina rebeller, tidigare världens kanske mest välorganiserade gerilla med som mest omkring 10 000 soldater. Både han själv och gerillasoldaterna bar alltid cyanidkapslar runt halsen som de skulle svälja i stället för att gripas av fienden.
Personkulten kring Prabhakaran var stark. Hans porträtt syntes överallt i tamilska områden. Själv befann han sig alltid på hemlig ort för att undgå den lankesiska armén. LTTE:s självmordskadrer — Svarta tigrarna — fick en måltid med sin ledare innan de utförde sina uppdrag. Efter den första självmordsattacken 1987 (datumet blev sedermera en helgdag hos gerillan) följde hundratals fler, mot militärer, politiker, ekonomiska mål och mot civila.