Delegationen leds av EU:s biståndschef Karel de Gucht och Sveriges biståndsminister Gunilla Carlsson som representant för unionens ordförandeland.
Gruppen möter både president Robert Mugabe och premiärminister Morgan Tsvangirai, som efter åratal i bitter opposition mot Mugabe nu leder en enhetsregering.
Mugabe – som inför besöket uttalade sig minst sagt ovänligt om EU-representanterna – ska nu ha välkomnat delegationen.
– Vi välkomnar er med öppna armar. Vi hoppas på givande samtal med positiva resultat, sade Mugabe före mötet.
De samtal som inleddes på förmiddagen är de första direkta på sju år.
Både EU och USA införde sanktioner mot Mugabes regim efter det kritiserade valet där Mugabe omvaldes till president 2002.
I fredags, när det förestående EU-besöket blivit känt, rapporterade massmedier i Zimbabwe att Mugabe uttalat sig i ett helt annat tonläge.
– Vem har sagt att britterna och amerikanerna ska härska över andra? Det är därför vi säger: Ner med er! Vi har inte bjudit hit de här djävla vitingarna. De vill lägga näsan i blöt i våra affärer. Vägra det! ska Mugabe då ha sagt.
– Vi hade en genomgripande diskussion som varade i mer än en timme, sade biståndsminister Gunilla Carlsson i telefon till TT efter att precis ha kommit ut från mötet med Zimbabwes president Robert Mugabe.
– Vi tog upp problemen med fortsatta övergrepp mot mänskliga rättigheter och med trakasserier mot MDC-medlemmar, men Mugabe ser uppenbart inte frågorna på samma sätt som vi.
Sveriges ambassadör Sten Rylander deltog också i mötet med den zimbabwiske presidenten.
– Ja, det var mycket bra, för Rylander har lång erfarenhet av hur Mugabe fungerar i sådana här sammanhang.
Robert Mugabe hade också, enligt Gunilla Carlsson, under mötet hänvisat flera gånger till gamla svenska vänskapsband mellan Sverige och Zimbabwe. Och tonen hade varit "artig och korrekt". Någonting som ens påminde om fredagens utfall om "djävla vitingar" förekom inte.
– Däremot tog han upp att han anser att det är USA och Storbritannien som är orsak till de problem Zimbabwe har i dag. Och när vi tog upp till exempel utnämningspolitiken och att samlingsregeringen har lång väg kvar innan den fungerar som den ska, var det också uppenbart att vi såg på frågorna på olika sätt, fortsatte Gunilla Carlsson, som ändå hoppas att besöket ska bli ett första steg mot en mer regelbunden politisk dialog mellan EU och Zimbabwe.
Under lördagseftermiddagen ska EU-trojkan resa vidare vill Zimbabwes näst största stad Bulawayo där MDC-ledaren och premiärministern Morgan Tsvangirai tar emot.
Förutom trakasserier och övergrepp är utnämningspolitiken och fördelningen av centrala ministerposter ett av de problem som präglat det år då samlingsregeringen varit i kraft. Mugabes parti Zanu-PF har väldigt svårt att släppa ifrån sig nyckelpositioner.