- Jag vill lämna ett budskap till våra vänner i Skottland och gratulera dem till deras mod och till att de visat sitt oberoende trots de oacceptabla och orimliga påtryckningar de utsatts för, sade Gaddafi efter mötet med al-Miqrahi.
Gaddafi talade i fredags med al-Miqrahi, hans anhöriga och ett stort antal släktingar till honom.
Den svårt cancersjuke Abd al-Basit al-Miqrahi säger i en intervju att han före sin död kan ta fram bevis på att han är offer för justitiemord i Lockerbiemålet. Han vidhåller sin oskuld i Londontidningen The Times som intervjuat honom i hans hem.
Han hävdar samtidigt att inte heller Libyen låg bakom sprängdådet.
Det är begripligt varför så många anhöriga är rasande över att han fått återvända till Libyen, säger al-Miqrahi.
- De hatar mig, det är naturligt. De tror att jag är skyldig fast jag i själva verket inte är det.
- En dag kommer sanningen fram. Vi har ett arabiskt ordstäv som säger att "sanningen dör aldrig".
Till USA:s president Barack Obama, som krävt att Libyen sätter honom i husarrest, hälsar han:
- Oroa dig inte Obama, det är bara tre månader kvar.
Det är så lång tid som läkare gett honom. Och han hör bara hemma på ett ställe, på sjukhuset, säger han.
Abd al-Basit al-Miqrahi avvisar påståenden om att de brittiska myndigheterna tvingat honom att ta tillbaka sin överklagan för att på så sätt dölja att han utsatts för justitiemord. Han avbröt den processen helt enkelt för att han skulle öka möjligheten att hinna bli fri före sin död. En överklagan kunde ta för lång tid.
Brittiska intressen i utvinningen av libysk olja och gas ligger bakom frigivningen av al-Miqrahi, uppgav Muammar Gaddafis son Seof al-Islami för den libyska tv-kanalen al-Mutawassit på fredagskvällen.
Den tidigare brittiska premiärministern Tony Blair har tagit upp al-Miqrahis fall vid varje besök i Libyen, sade Seof al-Islam. Han hävdade att fallet "alltid var med på förhandlingsbordet" om oljan och gasen.
Utrikesdepartementet i Storbritannien (UD) förnekade omedelbart hans uppgift.
- Alla beslut om al-Miqrahi har fattats av skotska ministrar och det skotska rättsväsendet, sade en talesman för UD i London.
Abd al-Basit al-Miqrahi dömdes 2001 ensam för sprängdådet mot ett Pan Am-plan över Lockerbie i Skottland i december 1988, då 259 människor ombord och elva på marken dödades. Men han har konsekvent hävdat sin oskuld. Han inledde också en ny process för att överklaga i år men avbröt den inför möjligheten att släppas fri av barmhärtighetsskäl.