Afghanska myndigheter anklagar norska Kirkens nödhjelp för att missionera för kristendom — ett brott som kan ge dödsstraff.
Organisationen utsätts nu för granskning, meddelade Afghanistans ekonomidepartement på söndagen.
Generalsekreteraren för Kirkens nödhjelp, Atle Sommerfeldt, förnekar bestämt anklagelsen. Han fruktar nu att den ska tas som förevändning för attacker.
- Det finns militanta grupper som kan ta till vilken förevändning som helst.
Hundratals andra hjälporganisationer ska också undersökas, sade en talesman för det afghanska departementet.
Tillkännagivandet gjordes sedan en tv-kanal angripit Kirkens nödhjelp.
- Vi ser väldigt, väldigt allvarligt på den här saken, sade Sediq Amarkhil, talesman för departementet.
- Om det visar sig att några hjälporganisationer bedriver verksamhet i strid med afghanska lagar och islam och försöker omvända folk till kristendom, då kommer vi inte bara att förbjuda organisationen, vi kommer också att överlämna saken till rättsmyndigheterna.
För några veckor sedan gav den afghanska regeringen order om nedläggning av 20 biståndsgrupper med motiveringen att de inte lämnat in rapporter om sitt arbete. Samtidigt beordrades nedläggning av 152 afghanska organisationer.
Sommerfeldt sade att Kirkens nödhjelp "har som global politik, och speciellt i Afghanistan, att inte arbeta med evangelisering eller att få människor att byta religion".
- Vi har samarbetat med afghanska organisationer i 30 år, och vi vet vad vi håller på med.
Kirkens nödhjelp har kontor i Kabul och i Maimana i Afghanistan. Organisationen har 50 anställda i landet, varav bara två utlänningar.