Spänningen steg under fredagsmorgonen på Västbanken inför fredagsbönen och Mahmud Abbas tal i FN på eftermiddagen.
Den israeliska armén meddelade att man höjt beredskapen och skickat fem extra bataljoner (mellan 400 och 1.200 man) till Västbanken för att förhindra oroligheter, uppger den israeliska tidningen Haaretz.
Armén fruktar att det ska bli våldsamheter mellan palestinier och israeliska bosättare.
Militären samarbetar med de palestinska myndigheterna för att hålla koll på läget.
Mindre oroligheter har förekommit både på Västbanken och i Gaza, särskilt efter Obamas tal i FN.