Rafsanjani sade också att många iranier tvivlar på valresultatet.
– Jag hoppas att vi nu har passerat den värsta delen av krisen, sade Rafsanjani, som för första gången sedan valet ledde fredagsbönen vid Teherans universitet.
Samtidigt protesterade tusentals iranier på Teherans gator och våldsamma sammanstötningar mellan polis och demonstranter och anhängare till oppositionsledaren Mir Hossein Mousavi förekom på flera håll i staden.
På gatorna i närheten av universitetet använde polisen tårgas för att skingra demonstranter och minst 15 personer greps, enligt AFP.Många av de protesterande bar ett grönt band, Mousavis färg under presidentvalskampanjen, och slagord som ”död åt diktatorn” kunde höras på gatorna, uppger BBC.
Det är första gången som en tidigare högt uppsatt iransk ledare kallar det som nu pågår i Iran för just en kris. Även om Rafsanjanis stöd för Mousavi och hans kritiska hållning till valresultatet och det som hände efteråt har varit känt är hans tal en direkt utmaning både mot den nuvarande andlige ledaren ayatolla Ali Khamenei och mot den sittande presidenten Mahmoud Ahmedinejad som vann valet.
Rafsanjani sade också att det nu är nödvändigt att återvinna folkets förtroende för det iranska politiska systemet. Rafsanjani var en nära medarbetare till den iranska revolutionens grundare ayatolla Khomeini och hänvisade till honom i talet.
– Han ville inte använda terror eller vapen, inte ens i strid, sade Rafsanjani enligt Reuters.
På fredagen gjorde också Mousavi, som anklagar den sittande regimen för valfusk, sitt första officiella framträdande sedan valet och deltog i fredagsbönen.
Den svenska frilansjournalisten Rashelle Tehrani är i Teheran och hon såg hur polis eller milis jagade demonstranter med pepparsprej:
– Både de som protesterar och vanligt folk var ute på gatorna. Jag såg många som hade Mousavis gröna band men även många andra. Folk sprang och ropade slagord. Jag hörde aldrig ”död åt diktatorn” men däremot ”Allahu akbar” – Gud är stor.
Rashelle Tehrani säger att det är oklart vilka som står för en del av våldet mot demonstranterna:
– Ofta är det inte riktiga poliser, snarare en sorts milis. Men det är ändå klart att de som gör det agerar på uppdrag av regimen.
Enligt Rashelle Tehrani gör de styrande allt för att hålla framför allt ungdomar inomhus och borta från gatorna.
– Den statliga televisionen har gått ut med att man ska sända 400–500 nya filmer från Europa och USA. Och det går fyra fem filmer om dagen på tv.
Hon säger också att de folkliga protesterna mot valresultatet egentligen aldrig upphört utan pågått konstant sedan valet i juni.
– Fortfarande går folk upp på hustaken över hela landet och ropar ”Gud är stor”. Och så länge demonstrationerna på gatorna är lugna och det inte riktas några slagord mot politikerna tillåts de pågå. Varje dag demonstrerar tusentals personer genom att med Koranen i handen eller på huvudet gå runt begravningsplatsen Beheshte Zahra strax utanför Teheran där ayatolla Khomeini är begravd.
– Där brukar man inte bära några andra symboler. Det är ett sätt av visa att det inte är islam de är emot.