Efter studierna arbetade han under en kort tid vid Göteborgs tingsrätt men var framför allt verksam vid krigsförbrytartribunalen i Haag när det gällde det forna Jugoslavien och Rwanda. Senare arbetade han också med att skriva domar på krigsförbrytartribunalen för Sierra Leone i Freetown.

I en intervju i oktober 2006 svarade han på frågan om vad han skulle vilja arbeta med: ”Ett jobb inom FN vore inte dumt, gärna med folkrättsfrågor.”

I november 2009 började Dungel arbeta som Senior Legal Adviser för Folke Bernadotteakademin i Hebron. En internationell insats med observatörer från Sverige, Norge, Danmark, Italien, Turkiet och Schweiz.

Dungel var hela tiden intresserad av att lära av de båda sidorna i en konflikt men framför allt att lyssna på civilbefolkningen och se till deras behov.

Informationschefen för FN-insatsen i Afghanistan, Kieran Dwyer, säger till BBC att FN-arbetarna fångades inne på anläggningen där de jagades utan att kunna ta sig därifrån: "Det här är civilpersoner, obeväpnade, som utför ett humanitärt arbete, de arbetar för fred i Afghanistan – ingen av dem var förberedd för en situation som den här", säger han till BBC.

I flera artiklar har Joakim Dungel lyft fram just civilbefolkningens umbäranden när deras land drabbats av krig. I en artikel i Journal of Humanitarian Assistance 2004 skrev Dungel om hur civilbefolkningen drabbas av konflikter där utomstående hjälparbetare förhindrats att komma in i landet.

Den 20 februari fyllde han 33 år.