Bombningarna inträffade i byn Ortasu i provinsen Sirnak natten mot torsdag, uppger AFP. De döda ska ha varit en del av en grupp på 40 personer i åldrarna 16 till 20 år som smugglade varor mellan Turkiet och Irak, enligt lokala källor.
Enligt Reuters sade Hüseyin Celik, talesman för det styrande partiet AKP, på en presskonferens att militären hade begått ett misstag.
– Det har slagits fast utifrån de första rapporterna att de här människorna var smugglare, inte terrorister, sade han.
Han försäkrade att ingen mörkläggning av händelsen skulle ske.
På eftermiddagen demonstrerade kurder mot attacken. Polis i Istanbul tog till tårgas och vattenkanoner för att skingra de omkring 2.000 personer som samlats på Taksirtorget.
Flera hundra ungdomar, många med halsdukar för sina ansikten, kastade stenar på polisen och slog sönder både civila bilar och polisbilar, rapporterar AFP. Demonstranterna visade upp porträtt på offren för attacken.
– Sådana här händelser är oacceptabla, sade Fehmi Yaman, borgmästare i Uledere i Sirnakprovinsen om attacken tidigare på torsdagen.
Representanter för kurderna befarade att militären inte skulle medge eventuella fel.
– Det är uppenbart att en massaker inträffat. De kommer att försöka mörklägga det. Vi kommer inte att tillåta dem att göra det, sade Selahattin Demirtas, en av ordförandena för det prokurdiska partiet Fred och Demokrati (BDP).
Enligt militären undersöks händelsen. Den utredningen bör ske av andra än militären, kräver Sermin Bozarslan, ordförande för Kurdiska Riksförbundet i Sverige.
– Utredningen mäste göras av en oberoende delegation, säger hon till DN.se.
Hon kunde vid klockan 13.30 inte uttala sig närmare om attacken, eftersom hon inte hunnit ta reda på vad som hänt.
Den turkiska militären bekräftade på torsdagen att man beordrat bombningen efter att obemannade flygplan, drönare, identifierat en misstänkt gerillagrupp, som enligt rykten planerade att attackera turkiska säkerhetsbaser.
– Det var omöjligt för oss att veta om dessa människor var PKK-medlemmar eller smugglare, sade en turkisk militärkälla till Reuters.
Det finns ingen civilbefolkning i området enligt militären.
BDP sade att man kommer att hålla demonstrationer i flera städer i Turkiet för att protestera mot attacken.
Smuggling är en viktig inkomst för boende i området. Där finns också viktiga gränsövergångar för PKK-medlemmar, enligt Reuters.
På Youtube finns en film som uppges visa dödsoffren för attacken. Den kan ses här.