Björn Ferry startade som sexa och slutade efter två bom på åttonde plats, 39,8 sekunder efter den segrande fransmannen Martin Fourcade.
Men Fredrik Lindström både sköt bättre och åkte ännu fortare i spåret.
Superlöftet från Anundsjö gick ut som 34:e man, 1.38 efter, men tog in hela 47 sekunder på täten och var till slut slagen med bara 51 sekunder.
Bara två åkare var snabbare än svensken i spåret.
- Helt otroligt bra. Det är det absolut bästa jag har gjort, sade Lindström, som efter en bom i det första skyttet sedan sköt fullt tre gånger i rad.
Efter det andra liggande skyttet fick han rygg på Björndalen. De båda följdes åt i två varv innan norrmannen bommade i det sista skyttet och fick ge sig.
Men alla tiders skidskyttekung hann bli imponerad av vad han sett.
- Han gjorde ett fantastiskt lopp. Han är ung och lovande och kommer att göra det bra framöver, sade Björndalen som inför sin hemmapublik nu kom på en blygsam 17:e-plats.
Martin Fourcade tog sin tredje världscupseger i rad, den här gången nio sekunder före tysken Simon Schempp, som sköt fullt och kom tvåa. Norrmannen Emil Hegle Svendsen tog sista pallplatsen när han slog ryssen Ivan Tjerezov i en tuff spurtuppgörelse.
Björn Ferry hade häng på Svendsen ut på slutvarvet men tappade på slutet.
- Det var så djävulskt tungt, jag orkade inte riktigt. Hade tredjeplatsen att kämpa om men jag var för trött, hade inte det där sista, sade Ferry.
Efter sin förkylning har han tappat en hel del ork och tror att söndagens masstart kan bli för tung för honom.
- Jag hoppas nästan mer på tävlingarna i Ryssland nästa vecka, sade han.
Fredrik Lindström finns inte bland de 30 bästa i världscupsammandraget och får därför inte köra masstarten. Inte den här gången.
Snart kommer han att vara given i det sällskapet.
- Hoppas det, nu vet jag ju verkligen att jag kan. Det blir inga gruvsamheter att börja en ny säsong om några månader, sade dagens snabbaste svensk.
Carl Johan Bergman sköt hela fem bom och slutade 32:a, slagen med 2.41. I sitt allra sista världscuplopp kom David Ekholm 54:a, 5.10 efter segraren Fourcade.