Han hoppas dock vara tillbaka till tisdagens möte med Finland.
Beslutet att låta Ibrahimovic vila var egentligen inte svårt att ta för förbundskapten Erik Hamrén.
– Nej, risken för bakslag är väldigt stort, och det känns dumt att chansa så att han missar båda matcherna. Därför väljer vi att förlänga förberedelsetiden så han kan vara tillbaka mot Finland, säger Hamrén.
Lagkaptenen kommer inte heller att följa med till Moldavien, utan stannar hemma i Sverige med sjukgymnasten Rickard Dahan.
Tisdagens magnetkameraundersökning visade inget nytt, så det enda som behövs nu är mer rehabiliteringsträning.
– Ambitionen är att han ska kunna träna fotboll med oss i helgen, men det beror ju lite på hur det fungerar med rehab. Jag har haft ett antal dagar på mig att fundera, och jag vet hur vi ska agera om han inte skulle kunna vara med. Vi har vunnit matcher utan Zlatan förr, och det kan vi göra även med den här, säger Hamrén.
Bland spelarna mottogs beskedet med besvikelse – även om det inte kom som en chock.
– Inte så jätteöverraskande. Jag har pratat med honom de senaste dagarna och anat att det skulle bli så här. Men hade han inte trott att han skulle kunna spela mot Finland hade han åkt hem direkt, och han är ju kvar. Så vi får hoppas på det i stället, säger till exempel Olof Mellberg.
Veteranen Anders Svensson:
– Det kan betyda en hel del för moldaverna. Det vet man ju själv i klubblaget, ska man möta "Blåvitt" och Tobias Hysén är skadad så är det inte en nackdel direkt. Zlatan är ju en spelare som kan avgöra en match på egen hand.
Planen var att Ibrahimovic i egenskap av lagkapten skulle följa med till Chisinau ändå, men på onsdagsmorgonen ändrade Hamrén sig.
– Jag tänkte på det under natten, och eftersom Leif Swärd (läkaren) tycker det är bättre för foten att vara hemma och undvika sammanlagt sex timmar på flyg, så gör vi så. Zlatan blev lite förvånad när jag berättade det, eftersom jag sade i går att han skulle med, men han förstod och accepterade det, säger Hamrén.
Landslagstruppen åker till Moldavien på torsdagsmorgonen.